Продолжаю переписку с самим собой, но потратил на поиски проблемы два месяца, вот и думаю - может, кому облегчу задачу.
Какое счастье! Я нашел, в чем дело! В прошлых версиях была только галка в квадратике (чекбокс), а теперь есть галка в квадратике (картинка selected/partselected/unselected) и просто галка (check_sel/check_unsel).
И вот в меню выбора карт или типов дорог или категорий ПОИ используется новая галка (check_sel), а у меня этой картинки не было. Скопировал картинку под новым именем. Теперь наконец-то галочки корректно рисуются!