Подтверждаю, что после установки обновлений они снова доступны в обновлениях карт. Предполагаю, что проблема в том, что карты "вшиты" в релиз программы и находятся в защищенной системной папке, в которой лежат и исполняемые файлы программы, Поэтому после загрузки программе не удается перезаписать файлы карт.
Что делать?